名和昆虫博物館の北側に位置する建物で、1906年（明治39年）12月22日起工、翌1907年（明治40年）6月16日に竣工しました。
この建物は、当時、特別昆虫標本室と呼ばれ、名和靖の志を理解した大阪朝日新聞社の土屋大夢氏の尽力により、大阪朝日新聞紙上で寄付金を募り、多数共鳴者の寄付により建てられたものです。設計は、昆虫博物館と同様、当時ヨーロッパから帰朝した武田五一氏で、赤い切妻屋根に小窓を配した木造・赤レンガ建ての欧風建物です。
標本収蔵庫として建てられたものですが、まだ博物館がなかったため、展示室も兼ねていました。本館に所蔵する昆虫標本は、およそ1万2千種30万頭。

・岐阜市重要文化財　1991年（平成2年）12月26日指定